Univerza na Primorskem Fakulteta za matematiko, naravoslovje in informacijske tehnologije
Več informacij o projektu / More info about the project
Opis / Description
Vstopamo v obdobje hitrega razvoja vrhunske tehnologije. Razvoj se je začel z masovno transkriptomiko, nadaljeval z epigenomiko, transkriptomiko posamezne celice, multiomiko in zdaj z epitranskriptomiko. Krožne RNK (circRNA) so fascinanten in nov razred RNK z edinstvenimi strukturnimi in funkcionalnimi lastnostmi, ki so ključni predmet epitranskriptomike. Njihova vloga in funkcija sta se šele začeli raziskovati, kar odpira široko polje novih raziskav.
S projektom želimo raziskati epitranskripcijske vplive na izgubo mišične mase in moči pri starejših odraslih. Z analizo krožne RNA (circRNA) v mišičnem tkivu oseb z normalno in zmanjšano mišično maso se želimo osredotočiti na regulatorne vidike teh molekul. Raziskava predstavlja nadgradnjo prejšnjih študij raziskovalke na področju epigenomike (snATAC-seq) in transkriptomike (snRNA-seq) v mišičnem tkivu.
Cilji projekta vključujejo karakterizacijo profilov circRNA z identifikacijo in kvantifikacijo circRNA v mišičnem tkivu. Dodatno bo raziskana povezava interakcij circRNA s podatki iz snATAC-seq in snRNA-seq in s tem integracija funkcionalne vloge circRNA v mišični biologiji.
Metodologija obsega izolacijo RNA, pripravo knjižnice za sekvenciranje, bioinformatično analizo podatkov in eksperimentalno validacijo ključnih ugotovitev. Projekt bo izboljšal razumevanje regulativnih mehanizmov circRNA, kar bo imelo potencialne klinične aplikacije pri zdravljenju mišičnih bolezni. Raziskovalka bo pridobila napredna znanja na področju sekvenciranja RNA in bioinformatike, kar bo okrepilo njeno raziskovalno kariero.